统计学习那些事

标签: 新闻 bioinformatics boosted trees boosting lasso | 发表时间:2011-07-08 09:43 | 作者:skywing Weyllor
出处:http://www.cvchina.info

统计学习那些事

香港科技大学 电子与计算机工程系 [email protected]

在港科大拿到PhD,做的是Bioinformatics方面的东西。Bioinformatics这个领域很乱,从业者水平参差不齐,但随着相关技术(比如Microarray, Genotyping)的进步,这个领域一直风风光光。因为我本科是学计算机电子技术方面的,对这些技术本身并没有多大的兴趣,支持我一路走过来的一个重要原因是我感受到统计学习(Statistical learning)的魅力。正如本科时代看过的一本网络小说《悟空传》所写的:“你不觉得天边的晚霞很美吗?只有看着她,我才能坚持向西走。”

离校前闲来无事,觉得应该把自己的一些感受写下来,和更多的爱好者分享。

先介绍一下我是如何发现这个领域的。我本科学自动化,大四时接触到一点智能控制的东西,比如模糊系统,神经网络。研究生阶段除了做点小硬件和小软件,主要的时间花在研究模糊系统上。一个偶然的机会,发现了王立新老师的《模糊系统与模糊控制教材》。我至今依然认为这是有关模糊系统的最好的书,逻辑性非常强。它解答了我当年的很多困惑,然而真正令我心潮澎湃的是这本书的序言,读起来有一种“飞”的感觉。后来我终于有机会来到港科大,成为立新老师的PhD学生,时长一年半(因为立新老师离开港科大投身产业界了)。立新老师对我的指导很少,总结起来可能就一句话:“你应该去看一下Breiman 和Friedman的文章。”立新老师在我心目中的位置是高高在上的,于是我就忠实地执行了他的话。那一年半的时间里,我几乎把他们的文章看了好几遍。开始不怎么懂,后来才慢慢懂了,甚至有些痴迷。于是,我把与他们经常合作的一些学者的大部分文章也拿来看了,当时很傻很天真,就是瞎看,后来才知道他们的鼎鼎大名,Hastie, Tibshirani, Efron等。文章看得差不多了,就反复看他们的那本书“The Elements of Statistical learning”(以下简称ESL)。说实话,不容易看明白,也没有人指导,我只好把文章和书一起反复看,就这样来来回回折腾。比如为看懂Efron的“Least angle regression”,我一个人前前后后折腾了一年时间(个人资质太差)。当时国内还有人翻译了这本书(2006年),把名字翻译为“统计学习基础”。我的神啦,这也叫“基础”!还要不要人学啊!难道绝世武功真的要练三五十年?其实正确的翻译应该叫“精要”。在我看来,这本书所记载的是绝世武功的要义,强调的是整体的理解,联系和把握,绝世武功的细节在他们的文章里。

由于篇幅有限,我就以Lasso和Boosting为主线讲讲自己的体会。故事还得从90年代说起。我觉得90年代是这个领域发展的一个黄金年代,因为两种绝世武功都在这个时候横空出世,他们是SVM和Boosted Trees。

先说SVM。大家对SVM的基本原理普遍表述为,SVM通过非线性变换把原空间映射到高维空间,然后在这个高维空间构造线性分类器,因为在高维空间数据点更容易分开。甚至有部分学者认为SVM可以克服维数灾难(curse of dimensionality)。如果这样理解SVM的基本原理,我觉得还没有看到问题的本质。因为这个看法不能解释下面的事实:SVM在高维空间里构建分类器后,为什么这个分类器不会对原空间的数据集Overfitting呢?要理解SVM的成功,我觉得可以考虑以下几个方面:第一,SVM求解最优分类器的时候,使用了L2-norm regularization,这个是控制Overfitting的关键。第二,SVM不需要显式地构建非线性映射,而是通过Kernel trick完成,这样大大提高运算效率。第三,SVM的优化问题属于一个二次规划(Quadratic programming),优化专家们为SVM这个特殊的优化问题设计了很多巧妙的解法,比如SMO(Sequential minimal optimization)解法。第四,Vapnika的统计学习理论为SVM提供了很好的理论背景(这点不能用来解释为什么SVM这么popular,因为由理论导出的bound太loose)。于是SVM成功了,火得一塌糊涂!

再说Boosted Trees。它基本的想法是通过对弱分类器的组合来构造一个强分类器。所谓“弱”就是比随机猜要好一点点;“强”就是强啦。这个想法可以追溯到由Leslie Valiant教授(2010年图灵奖得主)在80年代提出的probably approximately correct learning (PAC learning) 理论。不过很长一段时间都没有一个切实可行的办法来实现这个理想。细节决定成败,再好的理论也需要有效的算法来执行。终于功夫不负有心人, Schapire在1996年提出一个有效的算法真正实现了这个夙愿,它的名字叫AdaBoost。AdaBoost把多个不同的决策树用一种非随机的方式组合起来,表现出惊人的性能!第一,把决策树的准确率大大提高,可以与SVM媲美。第二,速度快,且基本不用调参数。第三,几乎不Overfitting。我估计当时Breiman和Friedman肯定高兴坏了,因为眼看着他们提出的CART正在被SVM比下去的时候,AdaBoost让决策树起死回生!Breiman情不自禁地在他的论文里赞扬AdaBoost是最好的现货方法(off-the-shelf,即“拿下了就可以用”的意思)。其实在90年代末的时候,大家对AdaBoost为什么有如此神奇的性能迷惑不解。1999年,Friedman的一篇技术报告“Additive logistic regression: a statistical view of boosting”解释了大部分的疑惑(没有解释AdaBoost为什么不容易Overfitting,这个问题好像至今还没有定论),即搞清楚了AdaBoost在优化什么指标以及如何优化的。基于此,Friedman提出了他的GBM(Gradient Boosting Machine,也叫MART或者TreeNet)。几乎在同时,Breiman另辟蹊径,结合他的Bagging (Bootstrap aggregating) 提出了Random Forest (今天微软的Kinect里面就采用了Random Forest,相关论文Real-time Human Pose Recognition in Parts from Single Depth Images是CVPR2011的best paper)。

有一个关于Gradient Boosting细节不得不提。Friedman在做实验的时候发现,把一棵新生成的决策树,记为f_m,加到当前模型之前,在这棵决策树前乘以一个小的数,即v×f_m(比如v=0.01),再加入到当前模型中,往往大大提高模型的准确度。他把这个叫做“Shrinkage”。接下来,Hastie,Tibshirani和Friedman进一步发现(我发现大师们都是亲自动手写程序做实验的),如果把具有Shrinkage的Gradient Boosting应用到线性回归中时,得到的Solution Path与Lasso的Solution Path惊人地相似(如图所示)!他们把这一结果写在了ESL的第一版里,并推测这二者存在着某种紧密的联系,但精确的数学关系他们当时也不清楚。Tibshirani说他们还请教了斯坦福的优化大师(我估计是Stephen Boyd),但还是没有找到答案。

Lasso & Boosting

后来Tibshirani找到自己的恩师Efron。Tibshirani在“The Science of Bradley Efron”这本书的序言里写道,“He sat down and pretty much single-handedly solved the problem. Along the way, he developed a new algorithm, ‘least angle regression,’ which is interesting in its own right, and sheds great statistical insight on the Lasso.”我就不逐字逐句翻译了,大意是:Efron独自摆平了这个问题,与此同时发明了“Least angle regression (LAR)”。Efron结论是Lasso和Boosting的确有很紧密的数学联系,它们都可以通过修改LAR得到。更令人惊叹的是LAR具有非常明确的几何意义。于是,Tibshirani在序言中还有一句,“In this work, Brad shows his great mathematical power–not the twentieth century, abstract kind of math, but the old-fashioned kind: geometric insight and analysis.”读Prof Efron的文章,可以感受到古典几何学与现代统计学的结合之美(推荐大家读读Efron教授2010年的一本新书Large-Scale Inference,希望以后有机会再写写这方面的体会)!总之,Efron的这篇文章是现代统计学的里程碑,它结束了一个时代,开启了另一个时代。

这里,想补充说明一下Lasso的身世,它的全称是The Least Absolute Shrinkage and Selection Operator,读音不是[‘læso]而是[læ’su:],有中文翻译为“套索”,个人觉得这个翻译不好,太远离它本来的含义,不如就用Lasso。Tibshrani自己说他的Lasso是受到Breiman的Non-Negative Garrote(NNG)的启发。 Lasso把NNG的两步合并为一步,即L1-norm regularization。Lasso的巨大优势在于它所构造的模型是Sparse的,因为它会自动地选择很少一部分变量构造模型。现在,Lasso已经家喻户晓了,但是Lasso出生后的头两年却很少有人问津。后来Tibshirani自己回忆时说,可能是由下面几个原因造成的:1. 速度问题:当时计算机求解Lasso的速度太慢;2. 理解问题:大家对Lasso模型的性质理解不够(直到Efron的LAR出来后大家才搞明白);3. 需求问题:当时还没有遇到太多高维数据分析的问题,对Sparsity的需求似乎不足。Lasso的遭遇似乎在阐释我们已经熟知的一些道理: 1.千里马常有,而伯乐不常有(没有Efron的LAR,Lasso可能很难有这么大的影响力)。2.时势造英雄(高维数据分析的问题越来越多,比如Bioinformatics领域)。3.金子总是会闪光的。

LAR把Lasso (L1-norm regularization)和Boosting真正的联系起来,如同打通了任督二脉(数学细节可以参考本人的一个小结[1],当然最好还是亲自拜读Efron的原著)。LAR结束了一个晦涩的时代:在LAR之前,有关Sparsity的模型几乎都是一个黑箱,它们的数学性质(更不要谈古典的几何性质了)几乎都是缺失。LAR开启了一个光明的时代:有关Sparsity的好文章如雨后春笋般地涌现,比如Candes和Tao的Dantzig Selector。伯克利大学的Bin Yu教授称“Lasso, Boosting and Dantzig are three cousins”。近年来兴起的Compressed sensing(Candes & Tao, Donoho)也与LAR一脉相承,只是更加强调L1-norm regularization其他方面的数学性质,比如Exact Recovery。我觉得这是一个问题的多个方面,Lasso关注的是构建模型的准确性,Compressed sensing关注的是变量选择的准确性。由此引起的关于Sparsity的研究,犹如黄河泛滥,一发不可收拾。比如Low-rank 逼近是把L1-norm从向量到矩阵的自然推广(现在流行的“用户推荐系统”用到的Collaborative filtering的数学原理源于此)。有兴趣的童鞋可以参考我个人的小结[2]

还必须提到的是算法问题。我个人觉得,一个好的模型,如果没有一个快速准确的算法作为支撑的话,它最后可能什么也不是。看看Lasso头几年的冷遇就知道了。LAR的成功除了它漂亮的几何性质之外,还有它的快速算法。LAR的算法复杂度相当于最小二乘法的复杂度,这几乎已经把Lasso问题的求解推向极致。这一记录在2007年被Friedman的Coordinate Descent(CD)刷新,至今没人打破。Hastie教授趣称这个为“FFT(Friedman + Fortran + Tricks)”。因为CD对Generalized Lasso问题并不能一网打尽,许多凸优化解法应运而生,如Gradient Projection, Proximal methods,ADMM (Alternating Direction Method of Multipliers), (Split) Bregman methods,Nesterov’s method (一阶梯度法中最优的收敛速度,Candes 的很多软件包都根据这个方法设计) 等等。哪个方法更好呢?这个就像问“谁的武功天下第一”一样。我只能回答“王重阳以后再也没有天下第一了,东邪西毒南帝北丐,他们各有各的所长,有的功夫是这个人擅长一些,而另外几门功夫又是另一个人更擅长一些”。有关L1的算法可能还会大量涌现,正如优化大师Stephen Boyd所说(2010年9月28日):“God knows the last thing we need is another algorithm for the Lasso.”

最后我想以讨论“模糊系统”和“统计学习”来结尾。这个话题非常具有争议,我就冒天下之大不讳吧,谈一谈我这几年的学习体会。记得十年前,立新老师曾经写过一篇文章《模糊系统:挑战与机遇并存——十年研究之感悟》,发表在2001年《自动化学报》上。我2005年看到的时候,敬仰之情,犹如滔滔江水。立新老师曾经有这么一句话:“If a method works well in practice, there must be some theoretical reasons for its success.”2005年的时候,我开始问自己什么使模糊系统的成功?立新老师认为有如下几个原因:1.模糊系统的通用逼近性能(Universal Approximator);2.模糊系统快速的构造算法,比如他自己的WM方法,Roger Jang的ANFIS等等;3.结果的可解释性;4.利用各种不同形式的信息。

下面我谈谈自己的看法,第一,通用逼近性能当然是一个好的性质,它表明模糊系统是很flexible的,但flexible的结构太多了,比如神经网络。问题往往不在flexible,而在太flexible导致overfitting。就如同SVM一样,没有L2-norm regularization,实践中的性能就会变得很差。第二,快速算法,这是好的方法必备的,SVM,Boosting,Random Forest的算法都很快,而且可以直接用到高维,这一点上,我没有看到模糊系统的优势。第三,可解释性:模糊系统对低维数据(比如2-4维)的确具有好的解释性(因为IF-THEN规则的前提和结论都很简洁),但这个时候其它工具也可以做得到,比如Gradient Boosting和Random Forests(很多例子可以在ESL这本书里看到)。第四,充分的利用各种信息。立新老师指的是IF-THEN规则可以比较自由灵活的加入先验知识,并在他的书里面详细给出实例。遗憾的是,这些例子都在处理低维空间的问题。如何用IF-THEN规则解构高维空间呢?我个人看不到它们特殊的优势。然而,在统计学习里,利用不同的先验知识处理高维空间的例子比比皆是,比如Sparsity,group-structure,smoothness等等。现在举一个Gradient Boosting  machine(GBM,也叫MART)的例子来说明我的观点。根据Lasso和Boosting的关系,可以知道GBM已经用到了Sparsity的性质(L1-norm regularization)。GBM有两个参数可以反映我们的先验知识。第一个参数是深度(depth),控制每棵决策树的深度 。如果深度为1,即树桩结构(Stump),表明GBM将采用加法模型(Generalized Additive model),即不考虑变量之间的交互式作用(Interaction);如果深度大于1,则考虑交互式作用。因为交互式作用在非线性建模中比较重要,如异或(XOR)问题,没有考虑交互式作用将失败得很惨,所以这个参数设置反映了对非线性建模的先验。第二个参数是Shrinkage的大小。假设深度选取是合理的,在噪声比较小的时候,没有Shrinkage会比较好;噪声比较大的时候,有Shrinkage会好一些。实践中,使用GBM对高维数据分析,试错法(Trial and error)很容易使用,因为就这两个参数(通常depth=3~4;实际数据的噪声往往比较大,推荐设置Shrinkage=0.01)。模型构建好之后,GBM会告诉你哪些变量是重要的,变量之间的交互式作用如何等等,这样模型的结果也是比较容易理解。Random Forests也有相似的功能。好了,最后借Hastie教授的一幅图来总结一下,无疑,GBM(MART)是他们的最爱,也是我的最爱。

Characteristics of some statistical models

结束语

问:世间是否此山最高,或者另有高处比天高?

答: 在世间自有山比此山更高,Open-mind要比天高。


[1] http://ihome.ust.hk/~eeyang/lars_Lasso_boost.pdf

[2] http://ihome.ust.hk/~eeyang/Learning_from_sparsity.pdf

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