几个高票答案说的都是现象而非原因。
对 @劉長曦 专栏提到的 g+ 讨论做了个摘要，出处在此
https://plus.google.com/105051985738280261832/posts/2FXDCz8x93s 首先，
安卓不缺硬件加速的支持。从安卓 1.0 开始，安卓就支持硬件加速。菜单的显示/隐藏、提醒的滑动渐变、Activity 之间的过渡以及对话框的显示/隐藏等都是经过硬件加速的。
但硬件加速与安卓「窗口」的概念有关。比如以下这张截图，就包含四个窗口：
状态栏窗口 / 壁纸窗口 / 壁纸上的启动器窗口 / 菜单窗口
安卓一开始的设计目标是「提供开放的应用平台」，在这种设计思路下，安卓通过许多个独立的 UI 元素来分享屏幕：比如输入法窗口和应用窗口就是两个不同的窗口。而同一个安卓应用，也由许多 Activity 组成（比如联系人列表是一个 Activity，联系人详情是另一个 Activity），每个 Activity 又有自己的窗口。发现了吗？
安卓 UI 一切皆窗口：从主屏打开联系人应用，你看到的是主屏窗口和联系人列表窗口的动画；按下联系人查看详情，是联系人列表窗口和联系人详情窗口的动画；显示输入法，是键盘窗口的动画..
. 早期的安卓使用软件来渲染窗口内的内容：在 2.3 前，窗口内容由软件渲染，而窗口的组合 / 移动则通过硬件加速绘制。
自安卓 3.0 起支持「全」硬件加速，原先由 CPU 完成的窗口渲染可通过 GPU 完成了。但许多老应用的 UI 组件不支持此功能，所以在开发者菜单中打开强制硬件加速可能会有各种异常出现。
但为什么即便支持了硬件加速，也不能完全保证流畅度呢？事实上，
安卓的这个多窗口设计，意味着 GPU 需要同时支持不同进程的多个活动 GL 上下文。而即便到现在，多数移动 GPU 执行上下文切换的代价还是相当高的。 虽然安卓有堆硬件这一说，但
硬件加速的资源也很容易被安卓的渲染机制吃光。比方说，Tegra 2 足够在 60 帧下把 1280*800 屏幕的每个像素点渲染 2.5 次。但安卓 3.0 中，光是打开「所有应用」的视图，就需要绘制许多不同的窗口：需要对所有像素绘制一次背景；（往少了说）需要对一半的像素绘制一次 shortcut 和 widget 层；需要对一半的像素绘制一次图标和标签；也需要对所有像素绘制一次「所有应用」视图的黑色背景，还有「所有应用」视图的图标和标签...还不算对这些窗口做最后的组合，就把 GPU 的资源吃光了。当然，安卓对这个机制也有优化，比如把壁纸做成一个比屏幕大的窗口，这样在主屏滚屏时就不需要重绘，只要移动窗口就行。而这个绘制好了的窗口，就不需要额外的 GPU 计算量了。
另一方面，OpenGL 硬件加速绘图也不是万能的，Nexus S 和 Galaxy Nexus 中，每个 OpenGL 应用会占用 8MB 内存。要知道 2MB 的进程开支都是个不小的代价。这 8MB 内存可能从后台进程那里分配而来，造成应用切换速度的下降。
为了提升流畅度，还需要许多其他方面的努力：安卓 1.6 对前后台进程调度的优化、2.3 中对输入系统的重写、 加入并发的垃圾收集等。举一个流畅度不由硬件加速决定的例子：对滚屏操作，Nexus S 在 ICS 上的流畅度比在 2.3 中要低。这其实是因为计时机制发生了变化，有时在 ICS 中，当应用接收触摸事件并绘图时，可能在尚未准备好的情况下就获得了下一个事件，从而导致跟踪手指移动时可能错过一帧，但这时帧率仍然是 60fps （这个 bug 已经修复了）。
@Julius 提到的是关于浏览器的渲染情况。在这方面，安卓和 iOS 的主要差别并非来自硬件加速绘图。早期安卓在渲染网页时做了与 iOS 不同的折衷：
将网页以序列方式连续显示，而非贴片方式。这样在滚屏和缩放时不会出现 Safari 那样的占位符，但渲染的帧率不够快。安卓 3.0 后改用了贴片方式，改善了滚屏和缩放的体验。但不论是安卓还是 iOS，贴片都是由 CPU 渲染的。
还有，「安卓后台应用太多吃资源」的说法也有问题。安卓的 UI 线程以默认优先级运行，后台线程以后台优先级运行。切换到后台的应用强制以后台优先级运行。而后台优先级利用了 Linux 的 cgroup 机制，它将所有的后台线程放进一个特别的调度组中，
它们满打满算也无法占用超过 10% 的 CPU 资源。
「安卓的触摸事件不像 iOS 那样优先」的说法也是错的。你可以架梯子看看安卓进程的优先级设定
http://developer.android.com/reference/android/os/Process.html#THREAD_PRIORITY_AUDIO 总的来说，根据 Dianne 的说法，多窗口设计对屏幕绘制的开销，是影响安卓的流畅度的已知因素之一。但决定「流畅」的因素还有很多，抓住某个特定技术细节不放的说法都是有失偏颇的。
以上。
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你都看到这啦，快来点我嘛 Σ(▼□▼メ)
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